En 2267, l'ambassadeur de la Fédération, a été envoyé à bord de l'U.S.S. Enterprise, en mission diplomatique en vue d'établir le contact avec la planète Eminiar VII.
Fox décide de négliger un signal provenant de la planète avertissant l'Enterprise de rester à distance, ce qui met la vie des membres d'équipage en péril lorsque le vaisseau est pris pour cible logique lors de l'une des attaques virtuelles émanant de Vendikar, Planète avec laquelle Eminiar VII est en guerre depuis plus de cinq siècles.
Après l'intervention radicale du capitaine Kirk qui détruit les ordinateurs avec lesquels cette guerre est menée, l'Ambassadeur Fox propose ses services de médiateur pour éviter une véritable guerre, et qui sait? Peut-être ramener la paix entre ces deux mondes.
Après la disparition mystérieuse de l'USS Defiant, l'Enterprise enquête dans le système Tholien. Kirk s'aperçoit alors que le Defiant est pris au piège entre deux hyperespaces et est piégé à son tour. Pendant ce temps, le Tholiens commencent à tisser une toile autour du vaisseau pour l'emprisonner et le détruire.