Dans le double-épisode "Dreamland" ("Zone 51") se cachent plusieurs références à Star Trek:
- Scully : "Dis-moi, au fait, au sujet de cette source clandestine qui t'a contacté, qu'est ce qui te dit qu'il ne s'agit pas encore d'un de ces barjots dont le savoir encyclopédique concernant une éventuelle vie extra-terrestre dérive exclusivement des multiples rediffusions de Star Trek"
- On découvre une séquence où Mulder, lorsqu'il était enfant, était déguisé en Spock, portant un uniforme scientifique de Starfleet et des oreilles vulcaines.
- Mulder : "Tu as raison Scully, encore un barjot qui a trop regardé Star Trek"
Le muon est, selon le modèle standard de physique des particules, le nom donné à deux particules élémentaires de charge positive et négative. Les muons ont une masse 207 fois [...]
Après la disparition mystérieuse de l'USS Defiant, l'Enterprise enquête dans le système Tholien. Kirk s'aperçoit alors que le Defiant est pris au piège entre deux hyperespaces et est piégé à son tour. Pendant ce temps, le Tholiens commencent à tisser une toile autour du vaisseau pour l'emprisonner et le détruire.