Dans le double-épisode "Dreamland" ("Zone 51") se cachent plusieurs références à Star Trek:
- Scully : "Dis-moi, au fait, au sujet de cette source clandestine qui t'a contacté, qu'est ce qui te dit qu'il ne s'agit pas encore d'un de ces barjots dont le savoir encyclopédique concernant une éventuelle vie extra-terrestre dérive exclusivement des multiples rediffusions de Star Trek"
- On découvre une séquence où Mulder, lorsqu'il était enfant, était déguisé en Spock, portant un uniforme scientifique de Starfleet et des oreilles vulcaines.
- Mulder : "Tu as raison Scully, encore un barjot qui a trop regardé Star Trek"
En théorie des cordes une brane, ou p-brane, est un objet étendu, dynamique, possédant une énergie sous forme de tension sur son volume d'univers, qui est une charge [...]
L'USS Enterprise rencontre une créature gazeuse responsable de la mort de plusieurs membres d'équipage sur l'USS Farragut en 2257, alors que Kirk servait sur ce vaisseau. Kirk n'a plus alors qu'une seule obsession: poursuivre et détruire la créature.